Terapia molecular bq36 Dr. Glez Castaño a definición y dianas




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fecha de publicación18.01.2016
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TERAPIA MOLECULAR BQ36 Dr. Glez Castaño


A) DEFINICIÓN Y DIANAS

  • La terapia molecular es el diseño de nuevas moléculas (DNA, RNA, proteínas…) en base al conocimiento de la estructura y función de las dianas moleculares, cuya función se desea interrumpir, disminuir, corregir o aumentar para obtener un efecto terapéutico en el individuo. La característica fundamental es que se conoce la diana.

NIVELES DE ACCIÓN

DNA  RNA  Proteína  Sustrato/Producto

1 2 2 3 4

Gen Expresión génica Proteína Metabolismo

NIVELES DE INTERVENCIÓN

1. GEN

  • Terapia génica o terapia por trasformación génica.

2. EXPRESIÓN GÉNICA

  • Intervención aumentando o disminuyendo la expresión génica:

  • Control de trascripción: metilación, desacetilación () y demetilación, acetilación () de las histonas.

  • Control de factores de trascripción (i.e. en la aterosclerosis).

  • Control de splicing de pre-mRNA.

  • Control del trasporte y traducción de mRNA.

3. PROTEÍNAS

  • Reemplazamiento de la proteína: extracelular o intracelular. Suministrada extracelularmente a nivel sistémico o dirigida a células específicas (i.e. insulina, factor VIII…)

  • Hay varios ejemplos de intervención sobre los mecanismos de señalización celular (por ejemplo, el ácido retinoico en el tratamiento de la leucemia promielocítica…):

  • Primeros mensajeros.

  • Maquinaria de transducción.

  • Segundos mensajeros. Maquinaria proteica de señalización celular.

  • Cascadas de proteína kinasas.

  • Control de la expresión génica.

4. MANIPULACIÓN METABÓLICA

  • Modificación enzimática (alteración de la catálisis): es la clásica, la más usada. Típico de enf metabólica.

  • Restringir la dieta (se restringe el sustrato).

  • Reemplazamiento de metabolitos o cofactores.

  • Inhibición de vías metabólicas.

  • Depleción de metabolitos tóxicos acumulados.

B) TERAPIA GÉNICA

  • Para entendernos, consiste en la introducción de un vector portador de un gen terapéutico en una célula diana.

  • Definición: Es la expresión de un nuevo gen introducido en células diana resultando en un cambio en las características funcionales de las células que produce un beneficio terapéutico para el paciente. La tª génica es una parte de la tª molecular.

  • Historia: Los hitos más relevantes en el desarrollo de la terapia génica son:

  • 1944: DNA como molécula con la información genética.

  • 1953: Descripción de la doble hélice.

  • 1974: Primer clonaje de un gen humano.

  • 1980: Primeros ensayos en animales de terapia génica.

  • 1990: Primeros ensayos en humanos.

  • 1999: Primera demostración de beneficio en humanos con terapia génica.

1. MATERIAL GÉNICO A TRANSFERIR Y VEHÍCULO

  1. DNA desnudo o en liposomas.

  2. DNA en virus.

  3. DNA en células: terapia ex-vivo o terapia génica somática. Se sacan las células del organismo, se les vehicula el DNA con virus, y se vuelven a introducir en el paciente.

Al mismo tiempo, es posible la vehiculación por virus que infecta células y éstas trasportan al virus.

2. TERAPIA GÉNICA EX VIVO / IN VIVO

  • Ex-vivo: Se aíslan células del paciente, se introduce el gen clonado con su vector, se incuban con el DNA que se quiere transferir, se seleccionan las células idóneas, y se introducen otra vez en el organismo una vez modificadas. Es la técnica más usada (99% de los ensayos de terapia génica son según esta técnica).

  • In-vivo (in situ): El vector con el gen clonado se introduce directamente en las células afectadas del organismo del paciente.

3. VEHÍCULOS DE TRASFERENCIA GÉNICA

  • Vamos a comparar la eficiencia de transferencia de los distintos vectores según su % de éxito al integrar o no los genes en el material genético del paciente/animal de experimentación:

    VEHÍCULO

    EFICIENCIA

    NOTAS

    1. DNA desnudo

    (plásmido, oligonucleótido)

    Muy baja

    Útil en tumores, al estar localizados. Sin interés en enfermedades sistémicas.

    2. Trasporte molecular

    (liposomas)

    20-100%

    (muy variable)

    Rodean el DNA, formando así micelas.

    3. Adenovirus, VHS, AAV

    100%

    Todas las células

    4. Retrovirus

    100%

    Pero sólo cels en ciclo celular (no en Go o G1). Restringe el tipo celular a usar para cultivo.

    5. Lentivirus

    100%

    A diferencia de anteriores, eficaz incluso en cels que no se dividen.

  • Los tres primeros se mantienen epigénicos, ya que no se integran. Los lentivirus y los retrovirus sí que se integran en el material genético celular (se hacen permanentes).

  • Usar retrovirus tiene el gran inconveniente de que la >ría de las células están en Go y no serán útiles.

4. PASOS SUCESIVOS PARA UNA BUENA TERAPIA GÉNICA

  1. Desarrollo del vector.

  2. Obtener la construcción genética adecuada para la transferencia.

  3. Proliferación y mantenimiento de las células diana.

  4. Transfección eficiente e integración del DNA.

  5. Expansión de células modificadas y transferencia al paciente.

Núcleo Expresión trangénica

Interacción Extracelular

DNA Vector Citosol Nucleasas Degradación

Exógeno Interacc

Membr plasmática

Endosoma Lisosoma

5. TRANSFERENCIA NO VIRAL

  • Vectores no virales:

  • Liposomas.

  • Complejos de liposomas- policationes.

  • Microinyecciones.

  • Uso de ligandos específicos: oligonucleótidos antisentido y plásmidos de expresión.

VENTAJAS DNA DESNUDO

  • Alto rendimiento en la obtención de material genético.

  • No se introducen genes víricos.

DESVENTAJAS

  • Baja eficiencia de transferencia.

  • Expresión no estable.

EJEMPLO

  • Oligonucleótidos con el DNA a transferir unidos a un ligando específico para un receptor celular: selectividad de receptor; sólo se introducirá en las células que tengan ese receptor.


Sí lo reconoce


No lo reconoce

6. VECTORES VIRALES

  • Virus DNA:

  • Adenovirus. El más usado hasta ahora. Episomal: no se integra en genoma por lo que se pierde con el tiempo.

  • Virus asociado adeno (AAV): Muy parecidos a los anteriores, pero sí que son capaces de integrar el material genético en el genoma. Uso en aumento.

  • Virus herpes simplex (VHS).

  • Virus RNA (retrovirus y lentivirus):

  • Virus de la leucemia murina (MuLV).

  • VIH. Estos dos se están empezando a usar ahora.

  • Human T-cell linfotrophic virases (HTLV).

ADENOVIRUS

  • Ventajas:

  • Alta eficacia de infección.

  • Alto nivel de expresión génica.

  • Capaces de acomodar moléculas de DNA algo mayores.

  • Desventajas:

  • Expresión transitoria.(episoma)

  • Difícil que infecten sólo las células diana (todas las células tienen receptores para ellos).

  • Por tanto, infectan muchos tipos celulares.

  • Producen una reacción inmunológica muy grande (puede llegar a ser letal).

    • El AAV mucho menos.

  • Menor seguridad.

  • Ejemplo de vector adenoviral:

L1 L2 (tardíos)

ITR E1 E3 (tempranos)

E2 E4 ITR

  • Se delecciona E1 y se introduce el gen (cDNA) que queremos modificar. Este gen E1 es un TF que expresar el genoma viral. Al heberlo quitado para meter nuestro cDNA necesitamos introducirlo por otro sistema: usamos células empaquetadoras.

  • Se usan células 293 que contienen genes capaces de empaquetar el virus, transfectadas con un vector que codifica para E1. Así el virus es capaz de replicarse en ellas produciendo muchas partículas que luego introduciremos en el paciente.

RETROVIRUS

  • Ventajas:

  • Integración en el genoma al azar.

  • Amplio espectro de huéspedes, pero podemos seleccionar las células diana.

  • El transgen se expresa durante tiempos muy largos, xq se integra.

  • Desventajas:

  • Genes para insertar de tamaño reducido.

  • Infectividad limitada a células que puedan proliferar in vitro.

  • Inactivación por la cascada del complemento.

  • Problemas de seguridad.

  • Ejemplo de vector retroviral: Virus de la leucemia murina.

  • Contiene un gen de resistencia a la neomicina para la selección celular.

  • El sitio de inserción es pequeño.

  • Se altera la secuencia de empaquetamiento. Sólo se empaqueta cuando transferimos el vector a una célula con capacidad de empaquetamiento.


Ψ es esencial para la encapsidación viral

Neo es el gen de resistencia a la neomicina (lo siento, no habrá Matrix4)

Pero falta la secuencia gag-pol-env fundamental para el empaquetamiento, y el vector no las tiene.

La cél empaquetadora presta este servicio (gag-pol-env) pero no tiene la secuencia Ψ; ésta será suministrada por el vector.

El VECTOR es DNA con un cDNA integrado y en la CÉLULA EMPAQUETADORA se trascribe a RNA y es empaquetado (allí sí hay gag-pol-env). Ese RNA, en las células del PACIENTE pasa a DNA y se integra, pero NO PUEDE REPLICARSE, porque no tiene el gen pol, luego este vector es MUY SEGURO.


C) OBJETIVOS DE LA TERAPIA GÉNICA

1. ATAQUE A CÉLULAS ENFERMAS: Aumento génico o muerte celular.

  1. Aumento génico en células enfermas: Células con fenotipo normal por aumento de expresión de un determinado gen.

  2. Gen de toxina en células enfermas: Muerte directa de las células que lo incorporan, ya que expresan el gen de una toxina.

  3. Gen conversor de una droga en células enfermas: Al suministrar la droga, mueren las células a las que se les ha transferido el gen.

    • i.e. Aciclovir inhibe la timidina kinasa específica del VHS. Si transferimos el gen de la TK del VHS a células tumorales, al administrar aciclovir mueren.

2. AUMENTAR LA RESPUESTA DEL SISTEMA INMUNE

  1. Transferencia del gen que codifica un antígeno determinado: las células enfermas lo expresan y son eliminadas por el sistema inmune.

  2. Gen codificante de una citosina: células enfermas producen citokinas que activan el sistema inmune y son destruidas.

3. INHIBICIÓN DIRIGIDA DE LA EXPRESIÓN GÉNICA

  • Esto lo podemos llevar a cabo sobre células enfermas que expresan un gen mutado que queremos anular, por medio de genes u oligonucleótidos antisentido.

  1. Bloquean la transcripción al unirse al DNA, formándose una triple hélice. Como las células normales no expresan el gen mutado, no se afectan.

  2. Bloquean la traducción al unirse al mRNA, no formándose la proteína. Actúan por dos mecanismos:

    • Bloqueo de la traducción.

    • Activación de RNAsas que degradan el RNA al que se unen.

Los TFO son oligonucleótidos que forman una triple hélice bloqueando la trascripción. Díficles usar in vivo.

  • También se emplean ribozimas. Los ribozimas son RNA catalíticos, que tienen unas secuencias denominadas “cabezas de martillo” que producen cortes específicos en las regiones complementarias del mRNA, degradándolo. El mRNA marcado/unido a estructuras antisentido no puede traducirse y además es degradado por estas RNAasas.

  • Otros sistema es el uso de RNA interferente: Se trata de toda una vía en plena investigación. Al final pongo mucha info para el que le flipe la Biología Molecular.

Se trata de un sistema que silencia la expresión del RNA mediante RNA de interferencia pequeños (siRNAs). Al introducir un RNA de doble cadena (dsRNA)en una célula, éstas se defienden mediante el procesamiento de este dsRNA por el Dicer, que corta la doble cadena en fragmentos pequeños de RNA obteniendo un dúplex de siRNA. A su vez, estos siRNA se unen a una compleja maquinaria llamada RISC que degrada o corta el mRNA simple en el punto que le marca el siRNA-RISC.

Se trata de medidas temporales pero extremadamente específicas.

En Nov de 2004, Nature publica que el siRNA modificado con colesterol permea mejor en las células y permite terapia sistémica

  • El conjunto estas técnicas conforman la llamada Terapia de Interrupción de Función.

4. REEMPLAZAMIENTO

  • Células enfermas con gen mutado: se coge el gen normal y se busca el gen mutado. Se trata de encontrar las zonas de recombinación (recom homóloga). El problema es que sólo ocurre en una de cada 1011 células cada vez: muy poco eficaz.

D) TERAPIA GÉNICA Y ÁREAS MÉDICAS

  • La terapia génica se emplea en la actualidad fundamentalmente en oncología (65%). A mucha más distancia se emplea en la cura de enfermedades monogénicas (22%).

E) PROBLEMAS DE LA TERAPIA GÉNICA

1. REACCIONES INMUNOLÓGICAS

  • Tiene lugar sobre todo con los adenovirus.

  • Se dio el caso de la muerte de un chico de 18 años a los cuatro días de tratamiento con terapia génica por déficit de ornitina decarboxilasa.

  • Mecanismo: Los adenovirus se adhieren a los macrófagos, produciéndose una liberación masiva de citokinas y fallo hepático y multiorgánico por una reacción inmune aguda contra el virus.

2. PROBLEMAS DE SEGURIDAD: Transformación celular mg

  • Caso de uso de terapia génica para síndrome de inmunodeficiencia común ligada al X (déficit de cadena gamma-L, común a varios receptores de interleukinas (IL 2, 15, 21, 7, 4, 9...), produciéndose un déficit total de linfocitos circulantes.

  • Se empleó un retrovirus con gen codificador de cadena gamma ex vivo para infección de células CD34+ de médula ósea y reinyección.

  • El problema fue la aparición de un linfoma linfoblástico T, a consecuencia de la inserción del retrovirus próximo al gen LMO-2 (factor de trascripción que al aumentar puede dar lugar a la aparición de linfomas T).

  • El programa se ha detenido en USA.

TESIS

  • Los virus transfieren lo que les inyectamos, pero quizá también más cosas que no controlamos.

  • Además al no saber donde se van a insertar en el genoma, puede que además se active la traducción de secuencias del genoma del individuo que no deseamos.

F) CONSIDERACIONES ÉTICAS

  • Uso de la terapia génica para otras aplicaciones: mejora funcional o fines cosméticos (calvicie, por transferencia génica a células foliculares; aumento de la masa muscular en atletas, aumento de estatura por transferencia de GH...)

  • Terapia génica somática in útero: sólo se deben tratar enfermedades muy graves y valorar en profundidad el riesgo para la madre y el feto. Hoy por hoy sólo se emplea esta técnica en afecciones muy muy graves.

  • Abuso del uso de las técnicas de clonaje para el clonaje reproductivo.

G) DEEP IN-SIGHT OF siRNAs:

No se dio en clase; esto es de mi cosecha para leer por amor al arte:


La historia comienza en la década de los ochenta, cuando se observó que algunas moléculas de RNA pequeño podían anular la expresión de varios genes en células de plantas y animales al adherirse a las cadenas de RNA mensajero (mRNA) e inhibir el proceso de síntesis proteica. El descubrimiento no tuvo mayor relevancia hasta que, en 1988, científicos de laboratorios estadounidenses realizaron el experimento de inyectar dos tipos de RNA pequeño (RNA sentido –el resultante de la transcripción– y RNA antisentido –el complementario al RNA sentido–) en células de gusanos. Estos RNA se unieron, dando forma a espirales de doble cadena de RNA pequeño. Para sorpresa de los investigadores, este RNA de doble cadena produjo una inhibición de los genes que estudiaban con una efectividad mucho más alta que la conseguida hasta ese momento con otros sistemas, como la adición de una sola cadena de RNA pequeño.

El siguiente aporte en esta historia, después del descubrimiento del RNA pequeño, ocurrió a mediados del 2002, cuando se identificó una encima llamada Dicer, encargada de producir en la célula las moléculas de RNA pequeño. Los trocitos cortados corresponden a dos clases de RNA pequeño, producido por diferentes tipos de genes: microRNAs y RNAs interferentes cortos (siRNAs).

Aunque aún no se sabe exactamente cómo se producen en la naturaleza estas moléculas, los científicos creen que la encima Dicer lleva RNA pequeño a una encima compleja llamada RISC, la cual usa su secuencia para identificar y degradar el RNA mensajero con una secuencia complementaria, y así frenar la expresión del gen.

La introducción de RNA de doble hebra (dsRNA) en una célula u organismo inicia una compleja cascada de eventos, los cuales culminan con la degradación del RNA mensajero (mRNA) de secuencia homologa al dsRNA originalmente introducido [9]. La primera fase del complejo de señalización está a cargo de una ribonucleasa tipo 3 denominada Dicer [2, 9]. Esta ribonucleasa fragmenta el dsRNA en porciones de 21-25 nucleótidos de longitud, los denominados siRNA o RNA interferentes pequeños. Estos siRNAs inducen la formación de un complejo de proteínas denominado RISC (del inglés RNA-Induced Silencing Complex) [9]. El RISC contiene una helicasa (aún no identificada molecularmente), la cual se encarga de separar las dos hebras del siRNA. Durante este paso, el RISC puede quedarse con la hebra sentido o la antisentido del siRNA. De quedarse con la hebra sentido, no existiría degradación del mRNA. De hecho, esta es la razón por la cual muchas secuencias de siRNAs no inducen RNAi. El mecanismo por el cual el RISC determina con cual hebra quedarse es complejo, pero descubrimientos recientes de nuestro grupo y otros [10] parecen indicar que la helicasa del RISC se queda con la hebra del siRNA que sea más fácil de abrir en su extremo 5´, es decir, la hebra que tenga el extremo 5´ con la menor ∆G en sus 4 últimas bases apareadas.

Una vez que el RISC se queda con la hebra sencilla antisentido, una proteína homologa a Dicer denominada recientemente Dicer2) con actividad de nucleasa se encarga de degradar el mRNA complementario a la secuencia del siRNA [1]. Dicer2 forma parte del RISC [1]. Si el RISC se quedara con la hebra sentido, no encontraría un mRNA de secuencia complementaria a la hebra sencilla, por lo que no se daría el fenómeno de RNAi. Al degradarse el mRNA existente en la célula no se producirá nueva proteína, resultando en la depleción de esa proteína en particular [7]. A la fecha no se ha encontrado actividad de RNA polimerasa dependiente de dsRNA en células de mamífero, en insectos aún queda por demostrarse [9].

En el caso de plantas es generalmente aceptado que el RNAi representa un mecanismo antiviral de defensa contra patógenos. Muchos virus de plantas tienen genomas de dsRNA o producen dsRNA intermediarios durante su replicación. Esto activa el mecanismo de RNAi, resultando en el silenciamiento de los genes virales y previniendo la propagación de la infección viral en la planta.

En animales superiores la situación es distinta, ya que poseemos un sistema inmune complejo y eficiente, motivo por el cual no sería muy obvia la necesidad de tener, además de la inmunidad humoral y celular, un sistema de RNAi para combatir infecciones. Descubrimientos recientes parecen indicar que el fenómeno del RNAi desempeña un papel mucho más sofisticado e interesante en animales, que el de combatir virus y patógenos. La capacidad de los organismos pluricelulares de producir durante su desarrollo diferentes órganos y células especializadas a tiempos muy específicos requiere la coordinación y control de la expresión de muchos grupos de genes. Los microRNAs son interruptores maestros que coordinan la expresión temporal de muchos genes que a su vez pueden controlar otros grupos de genes. Esta compleja coordinación espacio-temporal permite el desarrollo del sistema nervioso central, del aparato digestivo, y de las extremidades inferiores o superiores en animales, por ejemplo

A pesar de que se han identificado varios microRNAs en mamíferos, se desconoce a la fecha su función

precisa en el desarrollo de animales superiores [18].








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