Uso de microsatelites para la caracterización molecular de bancos de germoplasma de Cacao y Yuca en Nicaragua




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fecha de publicación30.01.2016
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Uso de microsatelites para la caracterización molecular de bancos de germoplasma de Cacao y Yuca en Nicaragua

1Erwin Aragón, 2Kenia María Herrera García, 2Jecsa Nubia Arguello Díaz; 3Víctor Aguilar Bustamante

El uso de microsatelites para la caracterización molecular de bancos de germoplasma permitió el conocimiento de la diversidad genética, así como la estructura genética de las colectas de Cacao y Yuca en Nicaragua. Para la caracterización molecular de 122 accesiones de Cacao, que contemplan 96 colectas nacionales, 21 híbridos de referencia y 5 materiales criollo referencia, utilizando 4 marcadores moleculares tipo SSR con el fin de conocer la diversidad genética de Cacao existente. Para realizar los análisis de diversidad genética se estimo la heterogosidad observada y esperada, numero de alelos por locus, contenido de información polimórfica, índice de Shannon. Los resultados preliminares muestran una alta heterogosidad esperada de 0.64 para los cuatro locus analizados. Para determinar la variabilidad genética de 34 accesiones de yuca colectadas en territorio nicaragüense, se incluyó como material de referencia 15 clones introducidos del CIAT Colombia y 3 introducidos de Brasil, con el objetivo de estudiar la diversidad genética e identificar duplicidad de accesiones. Los análisis de diversidad se obtuvieron de los datos de 9 marcadores microsatelites. Se detectó un total de 157 alelos en los nueve microsatelites, el número de alelos vario de 3 a 9, con un promedio de 5.22. El índice de diversidad genética fue bajo de 0.2. El valor promedio del PIC fue de 0.61, demostrando que los marcadores más informativos y polimórficos fueron el SSRY 100, GA 12 y GA 5, con alto poder de discriminación. El análisis molecular de varianza mostro que la mayor diferencia existe dentro del grupo, no así entre grupo. La mayor distancia genética determinada entre las poblaciones fue entre la población Matagalpa con la Rio San Juan, presentando menor distancia las RAAS con las Introducidas, mientras que la población Rio San Juan y León, presentaron la mayor identidad genética. El análisis de conglomerado mostro un coeficiente de correlación cofenética de 0.82 el cual agrupo seis grupos genéticamente idénticos. La información genética obtenida permitirá reducir los clones idénticos y seleccionar los de interés genético, para garantizar un manejo sostenible de los recursos que se dispone en el banco de germoplasma del CNIAB-INTA.

Palabras claves: Heterogosidad, Microsatelite, Germoplasma, Alelo, Diversidad

1 Especialista Agro biotecnología. INTA-CNIAB. Graduado M.Sc del programa NIFAPRO

2Egresada Ingeniería Agronómica

3 Dr. En agronomía, docente de la Universidad Nacional Agraria, Managua

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